摘要：在自然环境中存在着大量的微生物。这些微生物种群，尤其是许多新发性病毒，会对人和动物体的健康产生重大影响，而它们大多数都是不可培养的微生物。宏基因组学（metagenomics）的研究对象主要是非培养微生物。在特定环境中，它可有效地获取微生物种群的遗传组成、群落结构及生态作用等信息。随着高通量测序技术的快速发展，宏基因组学分析方法也已经应用到病毒学领域中，出现了病毒宏基因组学（viral metagenomics）。这一技术在新病毒鉴定等方面都取得了很多重要的研究成果。该综述主要对宏基因组学的发展历史、应用前景、生物信息学分析流程，及其在病毒鉴定中的应用进行简要介绍。

摘要：Yfr家族是广泛存在于蓝藻基因组中的一类非编码RNA，在细胞代谢和环境适应方面发挥重要作用。文中选取Yfr7作为研究对象，首先根据序列特征确定Yfr7的二级结构，然后结合动态规划和自由能的计算方法预测Yfr7的调控基因，从细胞定位、分子功能和调控路径三方面对这些基因进行分析，以快速发现Yfr7的功能．最后通过构建进化树来揭示Yfr7的遗传特征。结果表明：Yfr7拥有独立的启动子区和操纵子，通过保守片段5＇-GTGCTCTGATCTGACT-3’与目标mRNA序列互补来调控特定基因的表达；目标基因包括看家基因和酶基因，这些目标基因的功能说明Yfr7广泛参与细胞的次级代谢；进化树聚类表明Yff7与菌株光照类型有关，参与蓝藻最重要的光合反应；Yfr7与6SRNA在序列、结构和遗传距离上都高度一致，推测可能来自同一个祖先。这些研究结果可为进一步开展相关实验研究提供理论基础。

摘要：CD40是肿瘤坏死因子受体（tumomecrosis factor receptor, TNFR）超家族成员，表达于免疫细胞、造血细胞、血管细胞、内皮细胞及多种类型的癌细胞表面。作者采用计算机虚拟筛选和细胞实验相结合的方法，研究了CD40蛋白的全新多肽配体。首先，通过同源建模构建CD40蛋白的三维结构；然后，用分子对接虚拟筛选出靶向CD40的多肽配体；再通过表面等离子体共振（surface plasmon resonance, SPR）分子结合实验、多肽靶向脂质体的细胞实验，验证并确定被命名为N9的六肽为CD40的全新配体。进一步研究发现，N9修饰的脂质体对其靶向细胞Raji和树突状细胞（dendritic cells，DC）的转染效果明显提高，提示N9有靶向介导转染的功能。

摘要：HIV-2蛋白酶已成为治疗艾滋病的一个重要药物靶标。作者采用分子动力学模拟并结合自由能计算，研究了抑制剂Amprenavir（AMP）与HIV-2蛋白酶的作用机制。研究结果表明范德华作用是AMP与HIV-2蛋白酶结合的主要力量。采用基于残基的自由能分解方法计算抑制剂．残基相互作用，结果表明疏水性的CH-π和CH-O相互作用驱动了抑制剂AMP与HIV-2蛋白酶的结合。作者期望这一研究结果能为抗艾滋病双重抑制剂的研发提供一定的理论指导。

摘要：在研究果蝇胚胎期核小体定位时，发现不同表达模式基因上的核小体定位特征有着很大的差异。与以往研究结果不同的是，在果蝇胚胎期限制性表达基因的转录起始位点上游一l核小体位置上存在着H2A．Z核小体。有趣的是，与单细胞酵母基因上的核小体定位相比较发现，果蝇胚胎期限制性表达基因上的核小体排列与酵母极其相似。